Główny bioinformatyk (algorytmy i rurociągi cfDNA)

Natera poszukuje głównego bioinformatyka, który będzie rozwijał algorytmiczne podstawy naszych testów diagnostycznych wspierających zdrowie kobiet i narządów. Jest to indywidualna rola współtwórcy. Wniesiesz wiedzę z zakresu genomiki, której potrzebuje zespół, aby wyciągnąć wiarygodne sygnały z danych sekwencjonowania, które często są niejednoznaczne.

Zbudujesz podstawy metodologiczne i wdrożysz algorytmy potrzebne do wykrywania wariantów (SNV, Indels, CNV, SV), które trudno dokładnie określić w próbkach o niskiej frakcji (cfDNA płodu, dawcy). Idealny kandydat będzie miał głębokie doświadczenie w genomice algorytmicznej, dobre umiejętności programowania i pasję do opracowywania skalowalnych, klinicznie skutecznych narzędzi obliczeniowych. Główne obowiązki: Panel i badania laboratoryjne: Zapewnienie wglądu w algorytmy genomiki do naszego rozszerzonego planu działania panelu, w tym, które geny warto wziąć pod uwagę i dlaczego, współpracując z produktem, dyrektorami laboratoriów i działem badawczym, którzy wspólnie podejmują tę decyzję.

Pomóż zdefiniować podejście do trudnych analitycznie genów i przypadków skrajnych oraz porównać to, co jest naukowo możliwe do obrony, z tym, co jest technicznie możliwe. Strategia rozmówców i rozwój metod: Zdefiniuj strategię obliczeniową dla nowych rozmówców docelowych i specjalnego przeznaczenia. Pomóż zdecydować, kiedy nowy obiekt wywołujący jest uzasadniony, a kiedy zamiast tego należy rozszerzyć istniejącą metodę.

Prototypuj i testuj nowe metody oraz współpracuj z zespołem inżynierów, aby wdrożyć metody w produkcji. Badania naukowe i eskalacja: pełnij funkcję konsultanta ds. genomiki w przypadku złożonych eskalacji produkcji, oddzielając przyczyny biologiczne od analitycznych i rurociągowych. Rozpoznaj, kiedy wynik wygląda podejrzanie ze względu na to, skąd pochodzą odczyty, a nie dlatego, że analiza poszła nieprawidłowo.

Zamień jednorazowe dochodzenia w trwałe zasady i zmiany w projekcie, które ograniczają powtarzalność pracy. Jakość danych i partnerstwo międzyfunkcyjne: Działaj jako łącznik bioinformatyczny z zarządzaniem wariantami, raportowaniem i operacjami laboratoryjnymi w zakresie jakości danych, reprezentacji wariantów i integracji systemów. Podaj uzasadnienie naukowe, na którym opierają się odpowiedzialne działy ds. jakości i laboratorium, podejmując decyzję o gotowości metody do wdrożenia.

Sposoby pracy: Pomóż zdefiniować, jak prawidłowo wyglądają badania naukowe wspomagane sztuczną inteligencją, na przykład, jakie wnioski agent może, a czego nie, wyciągnąć z ustaleń na poziomie regionu bez zgody człowieka. Nie sprawdzamy wcześniejszego doświadczenia z tymi narzędziami, a wielu silnych kandydatów pochodzi ze środowisk, w których były one ograniczone; zapewniamy oprzyrządowanie i czas rampowy. Jak wygląda sukces po roku: Przyczynił się do naukowego i bioinformatycznego uzasadnienia planów rozwoju produktów.

Kryteria gotowości do wdrożenia nowych metod analizy istnieją i są w użyciu, a Ty sam przyczyniłeś się do powstania co najmniej jednego nowego lub rozszerzonego programu wywołującego. Zajmujesz się aspektami bioinformatycznymi w ramach złożonych badań produkcyjnych, nie czekając na ich przypisanie. Inne grupy wiedzą, że mogą zadać Ci pytania z zakresu genomiki dotyczące naszych testów.

Kwalifikacje: Wykształcenie wyższe z bioinformatyki, biologii obliczeniowej, bioinformatyki, genetyki człowieka lub dziedziny pokrewnej. Nie wymagamy doktoratu. lub M.S: równoważna głębokość zbudowana w wyniku pracy liczy się w pełni. Ponad 4 lata analizowania danych sekwencjonowania z krótkim odczytem do zastosowań przesiewowych lub diagnostycznych, najlepiej w warunkach regulowanych, akredytowanych lub w sąsiedztwie produkcji.

Liczymy odpowiednie doświadczenie od momentu, w którym Twoja praca stała się zasadniczo niezależna, niezależnie od tego, jak tam dotarłeś. Doświadczenie w przepływie pracy w bioinformatyce za testem lub panelem sekwencjonowania. Doświadczenie w prowadzeniu kompleksowego dochodzenia aż do rozwiązania przyczyn biologicznych, analitycznych i na poziomie systemowym.

Wiedza, umiejętności i zdolności: Co sprawdzamy. Doświadczenie w opracowywaniu, walidacji lub porównywaniu metod bioinformatycznych (np. SNV, CNV, SV), szczególnie w regionach trudnych analitycznie.

Biegła znajomość języka Python z udokumentowanym doświadczeniem w prototypowaniu narzędzi bioinformatycznych lub rozmówców. Wystarczająca głębokość genetyki człowieka, aby uwzględnić w projekcie panelu: widmo wariantów, częstotliwość populacji oraz obszary, w których można (i nie można) pójść na kompromis w zakresie dokładności. Znajomość identyfikowania regionów, w których nie można z pewnością umieścić krótkich odczytów: sekwencja homologiczna i pseudogeny, struktura o niskiej złożoności i powtórzeń oraz regiony o dużej liczbie kopii.

Doświadczenie w opracowywaniu projektów badań lub kryteriów wydajności dla metody analizy bioinformatycznej. Silni kandydaci mogą również posiadać doświadczenie w bezpośrednich, nieinwazyjnych badaniach prenatalnych, reprodukcyjnych lub w zakresie badań przesiewowych na nosicielstwo. Doświadczenie z cfDNA lub inną aplikacją, w której cząsteczki, na których Ci zależy, stanowią niewielką mniejszość tego, co zostało zsekwencjonowane.

Doświadczenie w opracowywaniu algorytmów dla platform sekwencjonowania o krótkim i długim odczycie (np. Illumina, ONT, PacBio). Wiarygodność międzyfunkcyjna dzięki doradztwu genetycznemu, zarządzaniu wariantami, raportowaniu i grupom sąsiadującym z produkcją.

Doświadczenie w akredytowanym lub laboratorium o dużej złożoności lub znajomość procesów wsparcia produkcji lub eskalacji. Przedział wynagrodzeń jest podany, a rzeczywiste pakiety wynagrodzeń opierają się na szerokiej gamie czynników unikalnych dla każdego kandydata, w tym między innymi na zestawie umiejętności, latach i głębokości doświadczenia, certyfikatach i konkretnej lokalizacji biura. Może się to różnić w innych lokalizacjach ze względu na koszty robocizny.

Zdalne USA 130 900 - 163 600 USD NASZA MOŻLIWOŚĆ Natera™ jest światowym liderem w dziedzinie badań bezkomórkowego DNA (cfDNA), poświęconym onkologii, zdrowiu kobiet i zdrowiu narządów. Naszym celem jest uczynienie spersonalizowanych testów i diagnostyki genetycznej częścią standardu opieki, aby chronić zdrowie i umożliwić wcześniejsze i bardziej ukierunkowane interwencje, które prowadzą do dłuższego i zdrowszego życia. Zespół Natera składa się z niezwykle zaangażowanych statystyków, genetyków, lekarzy, naukowców laboratoryjnych, profesjonalistów biznesowych, inżynierów oprogramowania i wielu innych specjalistów ze światowej klasy instytucji, którzy bardzo troszczą się o naszą pracę i siebie nawzajem.

Dołączając do Natery, będziesz ciężko pracować i szybko się rozwijać. Pracując u boku elity branży, będziesz pełen wyzwań i wyzwań. Będziesz dumny z bycia częścią firmy, która zmienia krajobraz zarządzania chorobami genetycznymi.

CO OFERUJEMY Konkurencyjne świadczenia - Świadczenia pracownicze obejmują kompleksowe plany medyczne, dentystyczne, okulistyczne, na życie i dotyczące niepełnosprawności dla uprawnionych pracowników i osób na ich utrzymaniu. Ponadto pracownicy firmy Natera i ich najbliżsi rodziny otrzymują bezpłatne badania oprócz świadczeń związanych z opieką nad niepłodnością. Inne świadczenia obejmują urlop ciążowy i wychowawczy, świadczenia 401 tys., świadczenia dla osób dojeżdżających do pracy i wiele innych.

Oferujemy również hojny program poleceń pracowniczych! Więcej informacji można znaleźć na stronie www.natera.com. Natera jest dumna z tego, że jest pracodawcą zapewniającym równe szanse.

Zależy nam na zapewnieniu zróżnicowanego i włączającego środowiska pracy i zapraszamy osoby z różnych środowisk, o różnym doświadczeniu, umiejętnościach i perspektywach. Współpraca włączająca przynosi korzyści naszym pracownikom, naszej społeczności i naszym pacjentom i ma kluczowe znaczenie dla naszej misji zmiany sposobu zarządzania chorobami na całym świecie. Zachęcamy wszystkich kwalifikujących się kandydatów do składania wniosków.

Zostaną rozpatrzeni bez względu na rasę, kolor skóry, religię, płeć, tożsamość lub ekspresję płciową, orientację seksualną, pochodzenie narodowe, genetykę, wiek, status weterana, niepełnosprawność lub jakikolwiek inny status prawnie chroniony. Rozważamy również kandydatów wykwalifikowanych, niezależnie od przeszłości kryminalnej, zgodnie z obowiązującymi przepisami. Jeśli mieszkasz w Kalifornii, zachęcamy do zapoznania się z tą ważną informacją dla mieszkańców Kalifornii.

Link: https://www.natera.com/notice-of-data-collection-california-residents/ Informujemy, że Natera skontaktuje się TYLKO z kandydatami posiadającymi domenę e-mail @natera.com. Wiadomości e-mail ze wszystkich innych nazw domen nie pochodzą od firmy Natera ani jej pracowników i są oszukańcze. Natera nie prosi o rozmowy kwalifikacyjne za pośrednictwem wiadomości tekstowych i nie prosi o podanie danych osobowych, dopóki kandydat nie nawiąże kontaktu z firmą i nie porozmawia z osobą rekrutującą oraz zespołem rekrutacyjnym.

Natera poważnie podchodzi do cyberprzestępstw i będzie współpracować z organami ścigania w celu ścigania wszelkich powiązanych cyberprzestępstw. Aby uzyskać więcej informacji: - Ogłoszenie BBB dotyczące oszustw związanych z ofertami pracy - Strona zasobów FBI Cyber ​​Crime Aplikuj bezpośrednio na RemoteJobs.org: https://remotejobs.org/remote-jobs/lead-bioinformatician-cfdna-algorithms-and-pipelines-natera