Główny bioinformatyk/inżynier (rurociągi i infrastruktura)

Natera poszukuje głównego inżyniera bioinformatyki, który będzie właścicielem rurociągów i inżynierii infrastruktury dla zespołu badawczego zajmującego się informatyką pracującego nad badaniami przesiewowymi bezkomórkowego DNA (cfDNA) w dziedzinie zdrowia kobiet i narządów. Jest to indywidualna rola współtwórcy. Będziesz właścicielem naszych przepływów pracy WDL, przejścia na Nextflow, infrastruktury AWS, na której pracuje zespół, oraz związanych z nimi narzędzi.

Odziedziczysz działający system od osoby, która go zbudowała, a wraz z nią nadal będziesz w zespole, który będzie Cię uczył. Nasze przepływy pracy zapewniają wyraźne korzyści pod względem kosztów i czasu wykonania każdemu, kto się nimi zajmie. Głównym założeniem tej roli jest doprowadzenie naukowców do momentu, w którym będą przetwarzać własne próbki od początku do końca, bez udziału inżyniera.

Główne obowiązki: Inżynieria przepływu pracy i rurociągów: Utrzymywanie i ulepszanie naszych przepływów pracy WDL w AWS Batch i AWS HealthOmics. Sprawdź, jak nowe przepływy pracy Nextflow i istniejące przepływy pracy WDL działają na jednym zestawie narzędzi i infrastruktury. Ułatw naukowcom prawidłowe działanie rurociągów bez wsparcia inżynieryjnego.

Infrastruktura i funkcjonalność: Posiadaj infrastrukturę AWS zespołu, zarządzaną jako kod w Terraform. Popraw niezawodność, odtwarzalność i obserwowalność w naszych środowiskach obliczeniowych. Twórz testy, monitoruj i ostrzegaj o awariach powierzchniowych, zanim naukowiec je znajdzie.

Wydajność narzędzi i programistów: Twórz i wzmacniaj narzędzia wewnętrzne, które ograniczają pracę ręczną zespołu, w tym wsparcie przy segregacji problemów produkcyjnych. Ułatw testowanie, dokumentowanie i przekazywanie nowych możliwości. Sposoby pracy: Używaj agentów kodujących jako rutynowej części inżynierii, do wdrażania, przeglądu kodu, badania i selekcji operacyjnej.

Jesteś właścicielem tego, co wysyłasz, niezależnie od tego, co go wyprodukowało, co oznacza przeglądanie i testowanie kodu napisanego przez agenta pod kątem tego samego standardu co Twój własny oraz pomaganie zespołowi w podjęciu decyzji, które z tych narzędzi warto zastosować. Współpraca i przekazanie: Współpracuj z kierownikami naukowymi zespołu i analitykami danych przy wprowadzaniu nowych metod do rurociągów produkcyjnych i zapewnianiu przeglądu pierwszej linii ich zmian, a także z organizacją produkcyjną w zakresie gotowości przekazania możliwości wycofujących się z badań. Jak wygląda sukces po roku: Jesteś właścicielem rurociągów i infrastruktury zespołu bez nadzoru.

Przejście na nowe przepływy pracy na tych samych narzędziach i infrastrukturze, co w przypadku naszych istniejących przepływów pracy. Naukowcy uruchamiają i debugują własne prace nad rurociągami, nie zgłaszając się wcześniej do Ciebie. Wyeliminowano przerwy operacyjne w pracy naukowej zespołu.

Praca z pomocą agenta jest normalną częścią Twojej pracy. Kwalifikacje: Wykształcenie wyższe z zakresu bioinformatyki, informatyki, biologii obliczeniowej lub pokrewnej dziedziny. Stopień nie jest wymagany: liczy się głębokość zbudowana dzięki pracy.

Ponad 4 lata doświadczenia w zakresie oprogramowania lub inżynierii rurociągów, najlepiej w naukach przyrodniczych, sekwencjonowaniu lub środowisku związanym z produkcją. Liczymy odpowiednie doświadczenie od momentu, w którym Twoja praca stała się zasadniczo niezależna, niezależnie od tego, jak tam dotarłeś. Wykazanie własności kompleksowego systemu.

Mamy na myśli uruchomienie go na produkcji, a nie tylko zbudowanie pierwszej wersji. Wiedza, umiejętności i zdolności: Co sprawdzamy pod kątem podstaw Strong Python i inżynierii oprogramowania, w tym praktyki testowania i debugowania. Doświadczenie z co najmniej jednym systemem przepływu pracy: Snakemake, CWL, WDL, Nextflow lub podobnym.

Prawdziwe doświadczenie w chmurze, najlepiej AWS, w tym zarządzanie infrastrukturą w postaci kodu. Używamy Terraform; inne narzędzie jest w porządku. Solidna praktyka w zakresie Linuksa, kontenerów i kontroli wersji.

Stworzyłeś co najmniej jeden przepływ pracy wspomagany sztuczną inteligencją, którego nadal używasz, i możesz powiedzieć, co go zastąpiło i skąd wiesz, że działa. Osiągnięcie szybkiego opanowania nieznanych narzędzi, lepsze niż jakiekolwiek konkretne narzędzie w Twoim CV. Jasna komunikacja pisemna, w tym dokumentacja, na podstawie której ktoś inny może podjąć działania.

Silni kandydaci mogą również mieć doświadczenie w Direct WDL lub Nextflow. Znajomość AWS Batch lub HealthOmics. Wystarczająca ciekawość naukowa, aby zrozumieć biologię stojącą za rurociągiem i zadać przydatne pytania na ten temat.

Przedział wynagrodzeń jest podany, a rzeczywiste pakiety wynagrodzeń opierają się na szerokiej gamie czynników unikalnych dla każdego kandydata, w tym między innymi na zestawie umiejętności, latach i głębokości doświadczenia, certyfikatach i konkretnej lokalizacji biura. Może się to różnić w innych lokalizacjach ze względu na koszty robocizny. Zdalne USA 130 900 - 163 600 USD NASZA MOŻLIWOŚĆ Natera™ jest światowym liderem w dziedzinie badań bezkomórkowego DNA (cfDNA), poświęconym onkologii, zdrowiu kobiet i zdrowiu narządów.

Naszym celem jest uczynienie spersonalizowanych testów i diagnostyki genetycznej częścią standardu opieki, aby chronić zdrowie i umożliwić wcześniejsze i bardziej ukierunkowane interwencje, które prowadzą do dłuższego i zdrowszego życia. Zespół Natera składa się z niezwykle zaangażowanych statystyków, genetyków, lekarzy, naukowców laboratoryjnych, profesjonalistów biznesowych, inżynierów oprogramowania i wielu innych specjalistów ze światowej klasy instytucji, którzy bardzo troszczą się o naszą pracę i siebie nawzajem. Dołączając do Natery, będziesz ciężko pracować i szybko się rozwijać.

Pracując u boku elity branży, będziesz pełen wyzwań i wyzwań. Będziesz dumny z bycia częścią firmy, która zmienia krajobraz zarządzania chorobami genetycznymi. CO OFERUJEMY Konkurencyjne świadczenia - Świadczenia pracownicze obejmują kompleksowe plany medyczne, dentystyczne, okulistyczne, na życie i dotyczące niepełnosprawności dla uprawnionych pracowników i osób na ich utrzymaniu.

Ponadto pracownicy firmy Natera i ich najbliżsi rodziny otrzymują bezpłatne badania oprócz świadczeń związanych z opieką nad niepłodnością. Inne świadczenia obejmują urlop ciążowy i wychowawczy, świadczenia 401 tys., świadczenia dla osób dojeżdżających do pracy i wiele innych. Oferujemy również hojny program poleceń pracowniczych!

Więcej informacji można znaleźć na stronie www.natera.com. Natera jest dumna z tego, że jest pracodawcą zapewniającym równe szanse. Zależy nam na zapewnieniu zróżnicowanego i włączającego środowiska pracy i zapraszamy osoby z różnych środowisk, o różnym doświadczeniu, umiejętnościach i perspektywach.

Współpraca włączająca przynosi korzyści naszym pracownikom, naszej społeczności i naszym pacjentom i ma kluczowe znaczenie dla naszej misji zmiany sposobu zarządzania chorobami na całym świecie. Zachęcamy wszystkich kwalifikujących się kandydatów do składania wniosków. Zostaną rozpatrzeni bez względu na rasę, kolor skóry, religię, płeć, tożsamość lub ekspresję płciową, orientację seksualną, pochodzenie narodowe, genetykę, wiek, status weterana, niepełnosprawność lub jakikolwiek inny status prawnie chroniony.

Rozważamy również kandydatów wykwalifikowanych, niezależnie od przeszłości kryminalnej, zgodnie z obowiązującymi przepisami. Jeśli mieszkasz w Kalifornii, zachęcamy do zapoznania się z tą ważną informacją dla mieszkańców Kalifornii. Link: https://www.natera.com/notice-of-data-collection-california-residents/ Informujemy, że Natera skontaktuje się TYLKO z kandydatami posiadającymi domenę e-mail @natera.com.

Wiadomości e-mail ze wszystkich innych nazw domen nie pochodzą od firmy Natera ani jej pracowników i są oszukańcze. Natera nie prosi o rozmowy kwalifikacyjne za pośrednictwem wiadomości tekstowych i nie prosi o podanie danych osobowych, dopóki kandydat nie nawiąże kontaktu z firmą i nie porozmawia z osobą rekrutującą oraz zespołem rekrutacyjnym. Natera poważnie podchodzi do cyberprzestępstw i będzie współpracować z organami ścigania w celu ścigania wszelkich powiązanych cyberprzestępstw.

Aby uzyskać więcej informacji: - Ogłoszenie BBB dotyczące oszustw związanych z ofertami pracy - Strona zasobów FBI Cyber ​​Crime Aplikuj bezpośrednio na RemoteJobs.org: https://remotejobs.org/remote-jobs/lead-bioinformaticianengineer-pipelines-and-infrastructure-natera